לעיתים, בניסיון לבצע טיפול שורש, אחד הפוצרים המשמשים לניקוי ולהרחבה של התעלה נשבר בעומק התעלה. מטופלים שמדווחים על נוכחותו של המכשיר השבור נוטים להיבהל, אך אין צורך בכך. המכשיר עצמו לא מהווה סכנה לגוף – הוא לא עובר קורוזיה (חלודה), אינו מטייל בתוך הגוף, אינו רעיל ולא גורם לדלקת. הבעיה היחידה במצב כזה היא שברגע שהפוצר נשבר בתעלה, הרופא לא מצליח לנקות את חלקה של התעלה שנמצא מעבר לפוצר. כלומר, קצה התעלה נותר מזוהם בחיידקים שהיו בו לפני הטיפול. במצבים כאלה רצוי לעקוף את הפוצר או להוציאו במידת האפשר. זהו תהליך מורכב, הדורש מיומנות וציוד מיוחד. במקרים מסוג זה מאתרת ד"ר דבורקין-קינן את הפוצר השבור באמצעות מיקרוסקופ, ובמידת האפשר מוציאה אותו תוך שימוש בציוד אולטרה-סוני, שגורם לו להתברג החוצה.