טיפול זה מבוצע במצבים שבהם נדרש חידוש טיפול שורש, אך לא ניתן לבצע אותו מסיבות אנטומיות (המבנה של השן או תעלה מסוידת שלא מאפשרת גישה אל האזור המודלק) או מסיבות שיקומיות (מבנה מסיבי שהוצאתו עלולה לסדוק את השן או כתר יפהפה שחבל להקריבו). במצבים הנ"ל אנו ניגשים אל קצה השורש, שם ממוקמת הדלקת, בגישה כירורגית דרך החניכיים. לאחר חשיפת קצה השורש מבוצע קיטום של קצה השורש, ניקוי קצה התעלה ואיטומה בחומר סתימה ייעודי.